开设的院系有：
电气工程与自动化学院、机械工程及自动化学院、数学与计算机科学学院、土木工程学院、环境与资源学院、生物科学与工程学院、外国语学院、物理与信息工程学院、建筑与城乡规划学院、紫金矿业学院、厦门工艺美术学院、材料科学与工程学院、法学院、至诚学院、海洋学院 应用技术与继续教育学院、马克思主义学院、人文社会科学学院、经济与管理学院、石油化工学院、化学学院、软件学院、福州大学梅努斯国际工程学院、先进制造学院、海外教育学院、体育教学部。
| 院系设置 | |||
| 电气工程与自动化学院 | 机械工程及自动化学院 | 数学与计算机科学学院 | |
| 土木工程学院 | 环境与资源学院 | 生物科学与工程学院 | |
| 外国语学院 | 物理与信息工程学院 | 建筑与城乡规划学院 | |
| 紫金矿业学院 | 厦门工艺美术学院 | 材料科学与工程学院 | |
| 法学院 | 至诚学院 | 海洋学院 应用技术与继续教育学院 | |
| 马克思主义学院 | 人文社会科学学院 | 经济与管理学院 | |
| 石油化工学院 | 化学学院 | 软件学院 | |
| 福州大学梅努斯国际工程学院 | 先进制造学院 | 海外教育学院 | |
| 体育教学部 | |||
