开设的院系有：
机械科学与工程学院、计算机科学与技术学院、生命科学与技术学院、电气与电子工程学院、材料科学与工程学院、船舶与海洋工程学院、能源与动力工程学院、人工智能与自动化学院、光学与电子信息学院、水电与数字化工程学院、软件学院、环境科学与工程学院、电子信息与通信学院、建筑与城市规划学院、土木工程与力学学院、化学与化工学院、数学与统计学院、物理学院、公共管理学院、经济学院、管理学院、人文学院、新闻与信息传播学院、马克思主义学院、社会学院、法学院、外国语学院、基础医学院、药学院、医药卫生管理学院、公共卫生学院、法医学系、护理学院、生殖健康研究所(原计划生育研究所)、第一临床学院、第二临床学院、第三临床学院、远程与继续教育学院、教育科学研究院、中欧清洁与可再生能源学院、体育学院、武汉光电国家研究中心、工程科学学院（国际化示范学院）、武汉国际微电子学院、航空航天学院、网络空间安全学院。
| 院系设置 | |||
| 机械科学与工程学院 | 计算机科学与技术学院 | 生命科学与技术学院 | |
| 电气与电子工程学院 | 材料科学与工程学院 | 船舶与海洋工程学院 | |
| 能源与动力工程学院 | 人工智能与自动化学院 | 光学与电子信息学院 | |
| 水电与数字化工程学院 | 软件学院 | 环境科学与工程学院 | |
| 电子信息与通信学院 | 建筑与城市规划学院 | 土木工程与力学学院 | |
| 化学与化工学院 | 数学与统计学院 | 物理学院 | |
| 公共管理学院 | 经济学院 | 管理学院 | |
| 人文学院 | 新闻与信息传播学院 | 马克思主义学院 | |
| 社会学院 | 法学院 | 外国语学院 | |
| 基础医学院 | 药学院 | 医药卫生管理学院 | |
| 公共卫生学院 | 法医学系 | 护理学院 | |
| 生殖健康研究所(原计划生育研究所) | 第一临床学院 | 第二临床学院 | |
| 第三临床学院 | 远程与继续教育学院 | 教育科学研究院 | |
| 中欧清洁与可再生能源学院 | 体育学院 | 武汉光电国家研究中心 | |
| 工程科学学院（国际化示范学院） | 武汉国际微电子学院 | 航空航天学院 | |
| 网络空间安全学院 | |||
