开设的院系有：
四海书院、国际学院、文学院、外国语学院、新闻与传播学院、艺术学院、经济学院、管理学院、创业学院、公共管理学院/应急管理学院、法学院/知识产权学院、国际关系学院/华侨华人研究院、理工学院、信息科学技术学院/网络空间安全学院、生命科学技术学院、生物医学转化研究院、医学部、药学院、华文学院、人文学院、翻译学院、国际商学院、深圳旅游学院、教育学院、体育学院、环境学院、马克思主义学院/社会科学部、产业经济研究院、光子技术研究院、质谱仪器与大气环境研究所、粤港澳中枢神经再生研究院、中国（广东）自由贸易试验区研究院、经济与社会研究院、先进耐磨蚀及功能材料研究院、化学与材料学院、纳米光子学研究院、环境与气候研究院、暨南大学伯明翰大学联合学院、新能源技术研究院、地下水与地球科学研究院、力学与建筑工程学院、基础医学院、中医学院、口腔医学院、第一临床医学院、衰老与再生医学研究院、护理学院、包装工程学院、先进与应用化诚合成研究院、智能科学与工程学院、电气工程学院。
| 院系设置 | |||
| 四海书院 | 国际学院 | 文学院 | |
| 外国语学院 | 新闻与传播学院 | 艺术学院 | |
| 经济学院 | 管理学院 | 创业学院 | |
| 公共管理学院/应急管理学院 | 法学院/知识产权学院 | 国际关系学院/华侨华人研究院 | |
| 理工学院 | 信息科学技术学院/网络空间安全学院 | 生命科学技术学院 | |
| 生物医学转化研究院 | 医学部 | 药学院 | |
| 华文学院 | 人文学院 | 翻译学院 | |
| 国际商学院 | 深圳旅游学院 | 教育学院 | |
| 体育学院 | 环境学院 | 马克思主义学院/社会科学部 | |
| 产业经济研究院 | 光子技术研究院 | 质谱仪器与大气环境研究所 | |
| 粤港澳中枢神经再生研究院 | 中国（广东）自由贸易试验区研究院 | 经济与社会研究院 | |
| 先进耐磨蚀及功能材料研究院 | 化学与材料学院 | 纳米光子学研究院 | |
| 环境与气候研究院 | 暨南大学伯明翰大学联合学院 | 新能源技术研究院 | |
| 地下水与地球科学研究院 | 力学与建筑工程学院 | 基础医学院 | |
| 中医学院 | 口腔医学院 | 第一临床医学院 | |
| 衰老与再生医学研究院 | 护理学院 | 包装工程学院 | |
| 先进与应用化诚合成研究院 | 智能科学与工程学院 | 电气工程学院 | |
