开设的院系有：
农学院、植物保护学院、园艺学院、林学院、生命科学学院、艺术学院 园林学院（合署）、动物科学学院（蜂学学院）、资源与环境学院、食品科学学院、材料工程学院、计算机与信息学院、机电工程学院、交通与土木工程学院、经济学院、管理学院 旅游学院、公共管理学院、马克思主义学院、国际学院? 留学预科学院（合署）、安溪校区"安溪茶学院、继续教育学院 远程教育学院（合署）。
| 院系设置 | |||
| 农学院 | 植物保护学院 | 园艺学院 | |
| 林学院 | 生命科学学院 | 艺术学院 园林学院（合署） | |
| 动物科学学院（蜂学学院） | 资源与环境学院 | 食品科学学院 | |
| 材料工程学院 | 计算机与信息学院 | 机电工程学院 | |
| 交通与土木工程学院 | 经济学院 | 管理学院 旅游学院 | |
| 公共管理学院 | 马克思主义学院 | 国际学院? 留学预科学院（合署） | |
| 安溪校区"安溪茶学院 | 继续教育学院 远程教育学院（合署） | ||
