甲工程公司承包施工的项目，在项目竣工交付后的第4年，由于屋面防水工程施工质量缺陷，导致工程的直接损失10万元人民币，维修恢复费用16万元人民币。根据《建设工程质量管理条例》的规定，甲工程公司( )。