雍正在位13年，对清廷机构和吏治做了一系列改革。如为加强对西南少数民族的统治，实行改土归流、耗羡银归公，建立养廉银制度等。特别是雍正七年(1729年)在出兵青海，平定罗卜藏丹津叛乱后，为提高军务效率，在离养心殿百步之遥的隆宗门内设立军机处，更是铸就了沿袭至清末的帝后独揽军政要务的集权模式。有鉴于康熙朝诸皇子争储位的惨痛教训，雍正创立秘密建储制，即将已选定的储君姓名，写好密藏匣内，再置于乾清宫“正大光明”匾后，以备不测。这一制度有助于以后乾嘉道咸几朝皇权的顺利过渡。
他是个明君而非仁君，明君指的是治理国家能力很强，但在某个地方也犯下了严重错误，但整体来说是七三开，即成绩七分，过错三分。
